Разрушители. Грибки и грядущая пандемия: читать начало книги онлайн

18 Casadevall A., Kontoyiannis D.P., Robert V. On the Emergence of Candida auris: Climate Change, Azoles, Swamps and Birds // MBio 10. August 27, 2019. № 4.

19 Артуро Касадевалл, интервью автора.

20 Forsberg K. et al. Candida auris: The Recent Emergence of a Multidrug-Resistant Fungal Pathogen // Medical Mycology 57. January 1, 2019. № 1.Р. 1–12.

21 Lee W.G. et al. First Three Reported Cases of Nosocomial Fungemia Caused by Candida auris // Journal of Clinical Microbiology 49. September 2011. № 9.Р. 3139–3142.

22 Jackson et al. On the Origins.

23 Chow N.A. et al. Potential Fifth Clade of Candida auris, Iran, 2018 // Emerging Infectious Diseases 25. 2019. № 9.Р. 1780–1781.

24 Брендон Джексон, интервью; Lockhart S.R. et al. Simultaneous Emergence of Multidrug-Resistant Candida auris on 3 Continents Confirmed by Whole-Genome Sequencing and Epidemiological Analyses // Clinical Infectious Diseases 64. 2017. № 2.Р. 134–140; Pfaller M.A. et al. Twenty Years of the SENTRY Antifungal Surveillance Program: Results for Candida Species from 1997–2016 // Open Forum Infectious Diseases 6, supplement 1. March 15, 2019. S. 79–94.

25 Об этом и гипотезе о том, что вирус был выпущен в результате утечки в лаборатории, написано немало. Horton R. Offline: The Origin Story – Towards a Final Resolution? // Lancet 399. January 1, 2022. № 10 319; Holmes E.C. et al. The Origins of SARS-CoV-2: A Critical Review // Cell 184. 2021. № 19. Р. 4848–4856. В 2022 году происхождение вируса было более определенно связано с оптовым продовольственным рынком Хуанань в Ухане, Китай. Worobey M. et al. The Huanan Seafood Wholesale Market in Wuhan Was the Early Epicenter of the COVID-19 Pandemic // Science. July 26, 2022. https://doi.org/10.1126/science.abp8715.

26 Замечательное исследование его эволюции и распространения см. в статье: Kiefer P. Genetic Tracking Helped Us Fight Ebola: Why Can’t It Halt COVID-19? // FiveThirtyEight, ABC News. April 15, 2020. https://fivethirtyeight.com/features/genetic-tracking-helped-us-fight-ebola-why-cant-it-halt-covid-19/.

27 Rossow J.A. et al. A One Health Approach to Combatting Sporothrix brasiliensis: Narrative Review of an Emerging Zoonotic Fungal Pathogen in South America // Journal of Fungi 6. 2020. № 4.Р. 1–27.

28 Что ученым известно о грибке C. auris, так это то, что он путешествовал не один. Как и Sporothrix, он, скорее всего, путешествовал по миру, цепляясь за хозяина-человека. Chow N.A. et al. Tracing the Evolutionary History and Global Expansion of Candida auris Using Population Genomic Analyses // MBio 11. February 16, 2022. № 2.

29 Hanson B.M. et al. Candida auris Invasive Infections during a COVID-19 Case Surge // Antimicrobial Agents and Chemotherapy 65. September 17, 2021. № 10.

3 °Cтюарт Левитц, интервью автору, 5 декабря 2019 года.

31 Там же.

32 Casadevall A. Fungal Diseases in the 21st Century: The Near and Far Horizons // Pathogens and Immunity 3. September 25, 2018. № 2.Р. 183.

33 Стюарт Левитц, интервью автору.

34 UNAIDS. Ending AIDS: Progress towards the 90-90-90 Targets. July 20, 2017. https://www.unaids.org/en/resources/documents/2017/20170720_Global_AIDS_update_2017; UNAIDS. UN AIDS Fact Sheet. https://www.unaids.org/en/resources/fact-sheet. О количестве криптококков см.: Rajasingham R. et al. Global Burden of Disease of HIV-Associated Cryptococcal Meningitis: An Updated Analysis // Lancet: Infectious Diseases 17. August 2017. № 8.Р. 873–881.

35 Стюарт Левитц, интервью автору.

36 Thompson G.R., Gintjee T.J., Donnelley M.A. Aspiring Antifungals: Review of Current Antifungal Pipeline Developments // Journal of Fungi 6. February 25, 2020. № 1.Р. 1–11.

37 Bhullar K. et al. Antibiotic Resistance Is Prevalent in an Isolated Cave Microbiome // PLoS One 7. 2012. № 4.

38 Horton M.V., Nett J.E. Candida auris Infection and Biofilm Formation: Going beyond the Surface // Current Clinical Microbiology Reports 7. 2020. Р. 51–56; Larkin et al. Emerging Pathogen Candida auris.

39 Lyman M. et al. Transmission of Pan-Resistant and Echinocandin-Resistant Candida auris in Health Care Facilities – Texas and the District of Colombia, January – April 2021 // Morbidity and Mortality Weekly Report 70. 2021. Р. 1022–23.

4 °Cтюарт Левитц, интервью автору.

41 В исследовании 2022 года C. auris был обнаружен в яблоках, выставленных на продажу в Индии. В свежесобранных яблоках не было обнаружено C. auris, и пока нет никаких доказательств связи между яблоками для продажи и вспышкой заболевания C. auris. Yadav A. et al. Candida auris on Apples: Diversity and Clinical Significance // MBio 13. March 31, 2022. № 2.C. auris также был выделен из тропической прибрежной среды: Arora P. et al. Environmental Isolation of Candida auris from the Coastal Wetlands of Andaman Islands, India // MBio 12. March 1, 2021. № 2.

42 Toda M. et al. Notes from the Field: Multistate Coccidioidomycosis Outbreak in U.S. Residents Returning from Community Service Trips to Baja California, Mexico – July – August 2018 // Morbidity and Mortality Weekly Report 68. April 12, 2019. № 14. Р. 332–333.

43 Мисуру Тода, личное общение с автором, 15 ноября 2021 года.

44 Gorris M.E. et al. Expansion of Coccidioidomycosis Endemic Regions in the United States in Response to Climate Change // GeoHealth 3. October 2019. № 10. Р. 308–327. См. GIF-анимацию: Climate Change to Accelerate Spread of Sometimes-Fatal Fungal Infection. https://news.agu.org/press-release/climate-change-expected-to-accelerate-spread-of-sometimes-fatal-fungal-infection/.

45 Centers for Disease Control and Prevention. Emergence of Cryptococcus gattii – Pacific Northwest, 2004–2010. https://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/mm5928a1.htm.

46 Engelthaler D.M., Casadevall A. On the Emergence of Cryptococcus gattii in the Pacific Northwest: Ballast Tanks, Tsunamis and Black Swans // MBio 10. October 1, 2019.

47 Teman S.J. et al. Epizootiology of a Cryptococcus gattii Outbreak in Porpoises and Dolphins from the Salish Sea // Diseases of Aquatic Organisms 146. 2021. Р. 129–143.